شناسایی، جداسازی و توالی یابی ژن های کنترل کننده رنگ پوشش در نژادهای گوسفندان بومی ایران

thesis
abstract

در پژوهش حاضر با هدف شناسایی و جداسازی ژن های موثر بر تمایز و توسعه رنگ پوشش در گوسفندان بومی کشور، 9 فنوتیپ با رنگ های گوناگون مربوط به 3 نژاد زندی، زل و بلوچی انتخاب و پس از تهیه نمونه های بافت پوست و خون، dna و rna نمونه ها با روش های استاندارد خالص سازی گردید. جهت شناسایی مسیرهای بیولوژیکی، ژن ها و پروتئین های موثر بر رنگ زایی در پستانداران، با استفاده از منابع اطلاعاتی موجود و بررسی جامع in silico، ژن کد کننده گیرنده ملانوکورتین 1 (mc1r) از خانواده g پروتئین ها به عنوان یک ژن کلیدی و موثر انتخاب گردید. این ژن از مهمترین عوامل تنظیمی در مسیر بیوشیمیایی ملانوژنز بوده و بر سنتز رنگدانه درون ملانوسیت ها و نسبت یوملانین به فئوملانین در بسیاری از جانداران اثرگذار است. جهت آنالیز بیان ژن، cdna نمونه های بافتی با الگو گرفتن از rna ساخته شده و با روش semi quantitative rt-pcr مورد بررسی قرار گرفت و مشخص شد ژن mc1r در فنوتیپ های زندی کبود و زل کبود بیان نسبی داشته و در سایر رنگ های پوشش مورد بررسی از قبیل سیاه یا سفید یکدست، شیری و قهوه ای بیان نمی شود. نواحی کد گذارنده ژن mc1r پس از طراحی آغازگرهای مناسب، بطور مستقیم از محصولات pcr توالی یابی شد. نتایج تعیین توالی، 8 جایگاه تغییر نوکلئوتیدی در ناحیه اگزونی 978 جفت بازی ژن را نشان داد. یکی از این چندشکلی های نوکلئوتیدی، c.606c>t است که باعث تغییر پروتئینی p.r65w در لوپ داخل سلولی، بین دو دمین ابتدایی پروتئین شده و با ضریب حذفی 93/0 می تواند تا حد زیادی بر ساختار سوم و عملکرد پروتئین اثرگذار باشد. از دیگر تغییرات می توان به c.852cg>gc اشاره نمود که در کلیه نمونه های بومی ایران شناسایی شده و با ایجاد دگرگونی p.r147a در لوپ دوم داخل سلولی پروتئین قابل توجه می باشد. تغییر سوم c.957g>a است که تغییر پروتئینی p.e182k در سومین لوپ خارج سلولی پروتئین mc1r را به دنبال دارد. توالی یابی ناحیه بالادست ژن، منجر به شناسایی 2 جایگاه متغیر شد که بر اتصال عوامل رونویسی مهمی مانند adr1 و gal4 اثر مستقیم دارند. پس از تعیین ژنوتیپ حیوانات به روش pcr-sscp در بالادست و اگزون ژن mc1r، میزان چندشکلی نوکلئوتیدی در این دو ناحیه از ژن به ترتیب معادل 0017/0 و 002/0 برآورد گردید. با توجه به دستاوردهای این پژوهش، تأثیر ژن mc1r در بروز تنوع رنگ پوشش گوسفندان بومی ایران، بسیار محتمل می باشد که نیازمند مطالعات تکمیلی است.

First 15 pages

Signup for downloading 15 first pages

Already have an account?login

similar resources

شناسایی و توالی یابی ژن mt-cox۱ در مرغ بومی خراسان

هدف از انجام این پژوهش بررسی توالی نوکلئوتیدی ژن سیتوکروم اکسیداز 1 در ژنوم میتوکندری مرغ بومی خراسان و شناسایی جهش های احتمالی در آن بود. بدین منظور پس از نمونه گیری و استخراج dna از خون کامل، ژن cox1 با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و در پلاسمید ptz57r/tدر سویه dh5α باکتری اشیریشیاکولای همسانه‎سازی گردید. در نهایت پلاسمید نوترکیب از یک کلونی نوترکیب استخراج و پس از خالص سازی توالی یابی ش...

full text

شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (HKT)

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می‌باشد، به طوری که سالانه میلیون‌ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک‌های زراعی می‌شود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین می‌کند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالی‌یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح DNA و RNA را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن HKT از گونه‌های زراعی و و...

full text

جداسازی و شناسایی اولین باکتری بومی کنترل کننده عامل بیماری شانکر مرکبات، Xanthomonas citri subsp.citri

بیماری باکتریایی شانکر مرکبات یکی از مخرب ترین بیماری های مرکبات می باشد و ازجمله بیماری های قرنطینه ای است که خسارت شدیدی بر تولید مرکبات در ایران وارد ساخته است. باکتری عامل این بیماریXanthomonas citri subsp.citri(xcici) می باشد. علی رغم وجود این بیماری در کشور ایران، تاکنون مطالعه ی دقیقی در جهت کنترل بیولوژیک آن انجام نگرفته است. پپتیدهای آنتی میکروبیال تولید شده توسط موجودات مختلف، برای ای...

full text

جداسازی و شناسایی باکتریهای بومی تجزیه کننده سلولز از خاک

مطالعه حاضر جداسازی و شناسایی باکتری¬های ترموفیلیک (°C 60) و مزوفیلیک (°C 37) تجزیه کننده سلولز را از خاک نشان می¬دهد. باکتری¬های ترموفیل و مزوفیل با استفاده از روش رقت¬سازی متوالی پس از غنی¬سازی محیطهای رشد در حضور میکروکریستالین سلولز به عنوان تنها منبع کربن، جداسازی و خالص¬سازی شدند. غربالگری باکتری¬های خالص سازی شده برای شناسایی باکتری¬های تولید کننده آنزیم سلولاز با استفاده از تکنیک زایموگ...

full text

شناسایی و بررسی جهش های ژن norA توسط توالی یابی نوکلئوتیدی در استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به سیپروفلوکساسین در شهرستان سنندج

مقدمه: فلوروکوینولون ‏ها از جمله آنتی­ بیوتیک‏ های مفید در مقابل عفونت­ های ناشی از باکتری استافیلوکوکوس اورئوس می ‏باشند اما امروزه ایجاد مقاومت نسبت به این دسته از آنتی ‏بیوتیک‏ ها یکی از مشکلات جدی در روند درمان بیماران به شمار می ­رود. از جمله مکانیسم‏ های ایجاد مقاومت فلوروکوینولونی در این باکتری‏ ها بیان بیش از حد ژن norA می ‏باشد که در این مطالعه بررسی شده است. مواد و روش ­ها: در این مطا...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023